In un giorno speciale, Amelie Bishop, una diciassette come le altre, rimane vittima di un incidente che provoca uno scossone imprevedibile nella sua vita di liceale.
Da un giorno all'altro, la sua vita cambia completamente e scopre che, aldilà della realtà che vede, c'è un mondo alternativo che la attende, più simile al nostro di quanto pensa ma allo stesso tempo pieno di magia e creature misteriose dotate di abilità ineguagliabili.
Entra a far parte di un rinomato istituto abitato da incantatori, in cui apprende la sua vera natura, seppur con alcuni interrogativi che non riescono a trovare risposta per quanto cerchi.
Quando una serie di misteriose sparizioni minaccia la sua nuova vita nell'Accademia, Amelie si troverà a indagare sui fatti accaduti, aiutata dai suoi nuovi amici e da un bizzarro fantasma che vive nell'istituto, giungendo infine ad apprendere una sanguinosa verità ormai sepolta...